特別天然記念物
（凡例）
〇実見 △遠望 ×消滅中
＊本格的な登山のため断念
※写真なし
＊アポイ岳高山植物群落
〇阿寒湖のマリモ
〇昭和新山
〇大雪山
〇野幌原始林
〇小湊のハクチョウおよびその渡来地
〇夏油温泉の石灰華
〇根反の大珪化木
〇焼走り熔岩流
＊早池峰山および薬師岳の高山帯・森林植物群落
×鬼首の雌釜および雄釜間歇温泉
〇玉川温泉の北投石
〇羽黒山のスギ並木
〇東根の大ケヤキ
＊コウシンソウ自生地
〇日光杉並木街道 附並木寄進碑（特別史跡と重複指定）
〇浅間山熔岩樹型
〇牛島のフジ※
〇御岳の鏡岩
〇田島ヶ原サクラソウ自生地
〇鯛の浦タイ生息地
〇大島のサクラ株
△ホタルイカ群遊海面
〇魚津埋没林
〇黒部峡谷 附猿飛並びに奥鐘山（特別名勝と重複指定）※
＊薬師岳の圏谷群
＊岩間の噴泉塔群
〇鳴沢熔岩樹型
〇上高地（特別名勝と重複指定）※
〇白骨温泉の噴湯丘と球状石灰石
＊根尾谷の菊花石
〇根尾谷断層
〇石徹白のスギ
〇狩宿の下馬ザクラ
〇湧玉池
〇長岡のゲンジボタルおよびその発生地
〇春日山原始林
＊大山のダイセンキャラボク純林
〇大根島の熔岩隧道
〇秋吉台
〇秋芳洞
〇八代のツルおよびその渡来地
〇加茂の大クス
〇宝生院のシンパク
〇八釜の甌穴群
〇高知市のミカドアゲハおよびその生息地
〇杉の大スギ
＊古処山ツゲ原始林
〇立花山クスノキ原始林
〇相良のアイラトビカズラ
〇青島亜熱帯性植物群落
〇都井岬ソテツ自生地※
×内海のヤッコソウ発生地
〇屋久島スギ原始林
〇蒲生のクス
〇喜入のリュウキュウコウガイ産地
〇鹿児島県のソテツ自生地
〇鹿児島県のツルおよびその渡来地
△枇榔島亜熱帯性植物群落
＊白馬連山高山植物帯
〇尾瀬※
計６１件(都道府県「定めず」１４件を除く)
〇４８ △２ ×２ ＊９ 実見率：５０／６１＝８２％